TAE=Tris base + acetic acid + EDTA
TBE=Tris base + boric acid + EDTA
TBE/TAE buffers are often used in镀镍 procedures involving D/RNAs.
Tris-acid solutionsare effective buffers to keep DNA deprotonated and s镀镍oluble in water.EDTAis a chelator of divalent cations, whichprotects the nucleic acids against enzym镀镍atic degradation。
WIKIPEDIA
BioEngX翻译时间:我们在进行DNA电泳时都会加入缓冲溶液,常用的缓冲溶液有TAE( 三羟基氨基甲烷+乙酸+EDTA),或者TBE(三羟基氨基甲镀镍烷+硼酸+EDTA )。想知道EDTA中文名字的看这里:乙二胺四乙酸。
缓冲液的作用是什么
缓冲液的作用之一是维持溶液的pH稳定。 电流通过水(H2O)时,在阳极发生氧化反应,生成氧气以及氢离子;在阴极发镀镍生还原反应,生成氢气以及氢氧根离子。长时间电泳将会使阳极变酸,阴极变碱。一个好的缓冲系统应该有较强的缓冲能力,使溶液两极的pH保持基本稳定。
电泳缓冲液的另一个作用是使溶液带有一定的导电性,以利于DNA镀镍分子的迁移。 DNA为碱性物质,在电泳(缓冲液pH=8)时带负电荷,由负极向正极迁移。
电泳缓冲液还有一个组分是EDTA,目的是螯合Mg2+等离子,防止电泳时激活DNA酶。由于核酸酶需要这些离子,EDT镀镍A可以将这些离子牢牢抓住,避免核酸降解。但要注意的是,镁离子同时是很多酵素的辅助因子,如限制酶、DNA聚合酶等等,因此EDTA的浓度一般不会太高(通常在1mM左右)。
TAE和TBE哪个更好
DNA电泳时镀镍应该用哪个?这其实取决于你的实验目的。下面我们来看看二者的区别[1]
TBE的电导率大于TAE的电导率。因此相比于TAE,TBE不太会导致电泳槽内过热的情况发生,长时间电泳推荐使用TBE。
硼酸是酶的抑制镀镍剂,因此如果你需要分离电泳的DNA用于酶切反应,建议使用TAE作为电泳缓冲溶液。
TBE对于较小片段的分离效果更好。对于小于300bp的片段,在2%的琼脂糖凝胶上,TBE中的迁移速度更快。
TAE适用于大镀镍片段的分离,大于2kb的片段在TAE中的迁移速度更快(0.8%的琼脂糖凝胶中),速度比在TBE中快出约10%
TAE更适用于回收DNA片段。
相比于TBE,TAE对于超螺旋的DNA分辨率更高[2]
TAE和镀镍TBE的配制方法
在本文的0后,我们列出TAE与TBE的配方以及配配制方法,供大家查询使用[3]。
TAE缓冲液
实验之中经常将TAE配制成10× 或者 50× 的储液,实验前稀释储液到1×的工作液。
1x 镀镍TAE 缓冲液的成分是:
40 mM Tris (pH 7.6)
20 mM acetic acid
1 mM EDTA
50x TAE储液配制方法:
将Tris(FW=121) 242g,100 ml 0.5镀镍 M EDTA, 57.1 ml的冰醋酸溶解在600 ml的去离子水中;而后调节pH至8.3,加去离子水定容至1L后,室温保存。使用时稀释50倍 即为1×TAE Buffer。
TBE缓冲液
TBE缓冲液镀镍可以配置成 5× 或者 10×的储液。
1x TBE 缓冲液的成分是:
89 mM Tris (pH 7.6)
89 mM boric acid
2 mM EDTA
10x TBE 储液配制方法:
将Tris(F镀镍W=121)108g,硼酸(FW=61.8)55g,40 ml 0.5 M EDTA 溶解在600 ml的去离子水中;而后调节pH至8.3,加去离子水定容至1L后,室温保存。使用时稀释10倍 即为1×镀镍TBE Buffer。
参考文献
[1] 三浦裕, 和気弘明, 加藤泰治. TBE, or not TBE; that is the question: Beneficial usage of tris-b镀镍orate for obtaining a higher resolution of small DNA fragments by agarose gel electrophoresis[J]. Na镀镍goya medical journal, 1999, 43(1): 1-6.
[2] Dingman C W, Peacock A C. Analytical studies on nuclear ri镀镍bonucleic acid using polyacrylamide gel electrophoresis[J]. Biochemistry, 1968, 7(2): 659-668.
[3] htt镀镍p://www.bio-rad.com/webroot/web/pdf/lsr/literature/Bulletin_6205.pdf
BioEngX---活跃在移动端的无国界学术圈持续镀镍推送生化工程领域科普文章、科研动态,分享实验技术及实验经验。
全国服务热线